Není internet jako internet - Biologický systém proti jedům

Komerční sdělení

Naše životní prostředí je zasaženo spoustou jedů. Jde o daň, kterou platíme za moderní civilizaci. Začali jsme ji skládat s příchodem průmyslové revoluce. Ta vedle bezpočtu skvělých vynálezů přinesla i jeden podstatný problém – velké množství škodlivých chemických látek. Vydrží ve vodě či v půdě stovky let. A škodí nám.

Typickým příkladem je TCP – rakovinotvorný trichlorpropan, který se využívá jako pesticid anebo solvent v chemickém průmyslu. Nedávno svitla naděje, jak se nechtěného TCP uloženého v půdě nebo vodě zbavit. Proteinoví inženýři z Loschmidtových laboratoří Masarykovy univerzity v Brně vyvinuli biologický systém, který ho dokáže účinně rozkládat.

Skupina vědců vedená Janem Brezovským a Zbyňkem Prokopem ve spolupráci se zahraničními experty navrhla a otestovala metabolickou dráhu obsahující nové bílkoviny, které jsou schopny přeměnit toxický TCP rychle a hospodárně na bezpečnou sloučeninu. Odborníci bílkoviny získali z obyčejné půdní bakterie Rhodoccocus. Jejich objev popsal prestižní časopis Nature Chemical Biology.

Cesta k takovému výsledku nebyla vůbec snadná. Vědci totiž museli propočítat obrovské množství variant řešení. K tomu potřebovali odpovídající technické vybavení. PC s klasickým připojením k internetu by jim určitě nestačilo.

Výhodou mezinárodního týmu bylo, že Česká republika patří mezi země, která je pokryta vyspělou vysokokapacitní síťovou infrastrukturou. Konkrétně národní e-infrastruktura CESNET poskytuje vědcům i dalším akademickým pracovištím špičkové přenosové parametry i přímé napojení na panevropské a globální projekty.

Odborníci z Loschmidtových laboratoří pro své záměry využili jednu součást komplexní e-infrastruktury CESNET, kterou je Národní gridová infrastruktura (mezi zasvěcenými známá jako MetaCentrum). Vědci v ní propočítali a nasimulovali bezpočet možných poměrů bílkovin v metabolické dráze, aby nalezli jejich nejúčinnější kombinace a koncentrace.

„Díky MetaCentru jsme mohli jednotlivé kombinace prozkoumat mnohem podrobněji, protože jsme si mohli dovolit nechat běžet i varianty pouze s minimálními vzájemnými odlišnostmi. Pokud se vezmou v úvahu požadavky na vysokou přesnost a spotřebu času náročných výpočtů diferenciálních rovnic, pak jsou gridové výpočty jedinou rozumnou volbou. Naše zkoumání tak mimo jiné potvrdilo zásadní roli gridových výpočtů pro vývoj komplexních biologických systémů,“ řekl vedoucí mezinárodního týmu Jiří Damborský.

Mohlo by vás zajímat

Finance
Chcete změnit zdravotní pojišťovnu? Máte čas do 30. září, jinak až za půl roku
Čínské turbulence na trhu s kryptoměnami
Nepovinný PES by měl podnikatelům usnadnit práci. V čem a jak?
Co je dobré vědět o superhrubé mzdě?
Polil vás v hospodě číšník? Kdo to zaplatí?
Auta
Malý crossover XC40 má po premiéře. Bude to první Volvo s…
Kolik toho doopravdy utáhne nový Land Rover Discovery? Možná se budete divit
Mitsubishi oživí jméno Evolution. Bude to koncept spojující vše, co fanoušci nenávidí
Lamborghini Huracán Super Trofeo Evo je „levná“ cesta k závodění
Člověk převlečený za sedadlo? Ano, i to je při vývoji autonomních vozů potřeba
Technologie
Další průšvih s 10nm procesem Intelu? Některé čipy Cannon Lake byly údajně odloženy
Děravý CCleaner byl nakonec zákeřnější. Cisco doporučuje obnovu systémů ze zálohy
Hotová informační průtrž. Google za dva týdny přestaví tyhle smartphony a počítače
Vyšla přelomová verze Minecraftu pro mobily, konzole a Windows 10
HEIF podporují Dropbox a Google Photos, zato OneDrive (a Windows 10) nikoli
Hry pro příležitostné hráče
Zavřít